Animal Genetic Evaluation Methods

General

• Code: 600-192010
• Semester: Elective Winter Semester
• Study Level: Undergraduate
• Course type: Special Background
• Teaching and exams language: Ελληνικά
• The course is offered to Erasmus students
• Teaching Methods (Hours/Week): Διδασκαλία (4)
• ECTS Units: 4
• Course homepage: https://moodle.teithe.gr/course/view.php?id=3897

Course Contents

Εκτίμηση των Κληροδοτικών Τιμών. Φαινοτυπικές αποδόσεις σε διαφορετικές συνθήκες του περιβάλλοντος. Εκτιμήσεις των κληροδοτικών τιμών για μια ιδιότητα από διάφορες πηγές πληροφοριών [π.χ. Ατομική επιλογή, Άμεση ατομική επιλογή, Ατομική επιλογή με επαναλαμβανόμενες ιδιότητες, Έμμεση ατομική επιλογή, Προγονικήεπιλογή(μία προγονική απόδοση, περισσότερες προγονικές αποδόσεις), αδελφική επιλογή (Sibselection), Οικογενειακή επιλογή, Απογονικός έλεγχος (Progenytesting)].
Συνδυασμένη ατομική-οικογενειακή επιλογήμε Δείκτη Επιλογής.Εκτίμηση Ολική κληροδοτικής τιμής. Ακρίβεια εκτίμησης κληροδοτικών τιμών και ολικής κληροδοτικής τιμής.
Ανίχνευση Γονιδιακών Τόπων Ποσοτικών Ιδιοτήτων (QuantitativeQTLdetection)
Ανάλυση Ολικής Γενωμικής Συσχέτισης

Μέθοδοι γενετικής αξιολόγησης:
α) Πρώτιστηγραμμική αμερόληπτη πρόβλεψη (BesτLinearUnbiasedPrediction, BLUP) με πολυγονιδιακό πρότυπο
• με μια ιδιότητα
• με μια επαναλαμβανόμενη ιδιότητα (repeatabilitymodel)
• με πολλαπλές ιδιότητες (multitraitmodels).

β) Επιλογή Υποβοηθούμενης από Γενετικούς Δείκτες
• MarkerAssistedSelection με BLUP

γ) Γενωμικήεπιλογή (Genomic Selection)
• GBLUP (Genomic Besτ Linear Unbiased Prediction)
• Κατά Bayes (Μέθοδοι Bayes A και Bayes B)

Educational Goals

Σκοπός του μαθήματος είναι να εισάγει τον φοιτητή στις βασικές έννοιες …

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος ο φοιτητής/τρια θα είναι σε θέση:

• Να αναλύει την…
• Να περιγράφει τις…
• Να κατανοεί το…
• Να συγκρίνει τα…

General Skills

• Αναζήτηση, ανάλυση και σύνθεση δεδομένων και πληροφοριών, με τη χρήση και των απαραίτητων τεχνολογιών
• Αυτόνομη εργασία
• Ομαδική εργασία
• Παράγωγή νέων ερευνητικών ιδεών

Teaching Methods

Στην αίθουσα διδασκαλίας και στο Εργαστήριο πρόσωπο με πρόσωπο.

Use of ICT means

• Το Θεωρητικό και το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος πραγματοποιείται εξολοκλήρου με τη χρήση ηλεκτρονικών πολυμέσων.
• Οι ανάγκες της θεωρητικής διδασκαλίας του εν λόγω μαθήματος καλύπτονται με computer, σύνδεση Internet και dataprojector.
• Το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος γίνεται εξολοκλήρου με Η/Υ και εξοικείωση με εξειδικευμένα λογισμικά γενετικής αξιολόγησης και ανάλυση παραδειγμάτων.
• Ως Εκπαιδευτικό Λογισμικό χρησιμοποιούνται :
  Ι. PEST byGroonevelt (Για την γενετική αξιολόγηση)
  ΙΙ. ASRemlbyGilmour (Για την γενωμική αξιολόγηση)

Teaching Organization

Students Evaluation

• Εκπόνηση Εργασίας (30%)
• Γραπτή τελική εξέταση (70%) που περιλαμβάνει εργαστηριακές ασκήσεις και ερωτήσεις.

Recommended Bibliography

1. Ρογδάκης, Ε., 2009. Γενετική Βελτίωση Αγροτικών Ζώων. Εκδόσεις: Σταμούλη, Αθήνα.
2. GroeneveldE, KovačM, MielenzN. 2010. VCE User’s Guide and Reference Manual, version 6.0. Institute of Farm Animal Genetics; Neustadt, Germany.
3. Butler, D.G., Cullis, B.R., Gilmour, A.R., Gogel, B.G., Thompson, R., 2017. ASReml-R Reference Manual Version 4. VSN International Ltd, Hemel Hempstead, HP1 1ES, UK.

Related Research Journals

1. Animal Breeding and Genetics
2. Animal Genetics
3. Genetics-Selection-Evolution.